我校拟对真核转录组测序项目采用校内询价方式采购，现将有关事项公告如下：

一、投标人的资格：  

1.符合《中华人民共和国政府采购法》第二十二条的规定且为中华人民共和国境内注册的具有独立法人资格的法人。

2.对在“信用中国”网站(******)、中国政府采购网(******)等渠道列入失信被执行人、重大税收违法案件当事人名单、政府采购严重违法失信行为记录名单及其他不符合《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定条件的供应商，不得参与本次采购活动。

二、询价项目：

项目名称：真核转录组测序

三、询价内容及要求:

1.参考型号及参数要求

本项目真核转录组测序核心设备参考型号为Illumina NovaSeq 6000（或同级别及以上性能设备，需提供详细技术证明材料）。

2.测序平台参数

测序读长：支持双端测序，读长≥2×150bp，确保对转录本的覆盖度和拼接准确性，满足可变剪切、融合基因等复杂结构的检测需求。

测序深度：每个样本测序深度≥60G clean data，其中mRNA测序需保证≥4000万条clean reads，lncRNA测序需保证≥6000万条clean reads，以确保低表达基因的有效检出。

数据质量：Q30碱基比例≥90%（Q30表示碱基识别准确率≥99.9%），GC含量分布符合真核生物基因组特征，无明显偏向性；adapter去除率≥99%，确保数据无污染。

运行效率：单Flow Cell运行时间≤3天（针对600G数据产出量），具备高效的样本处理能力，可满足项目整体时间进度要求。

3.文库构建参数

RNA质量要求：样本总RNA纯度OD260/280=1.8-2.2，OD260/230≥2.0；RNA完整性RIN值≥7.0（植物组织样本），确保RNA无降解。

文库类型：支持链特异性文库构建，可区分正义链和反义链，提高基因表达定量的准确性；文库插入片段长度范围150-300bp，且片段分布均匀。

建库重复性：同一样本重复建库的相关系数R2≥0.98，确保实验操作的稳定性和可靠性。

4.数据分析参数

比对软件：采用HISAT2比对软件，比对到参考基因组的效率≥85%（针对已知参考基因组物种）；对于无参考基因组物种，需提供denovo组装服务，组装得到的unigene N50≥1000bp。

差异表达分析：支持DESeq2、edgeR等工具进行差异基因筛选，筛选标准可自定义（如|log2FC|≥1且padj<0.05）；提供差异基因的GO功能注释和KEGG通路富集分析，注释数据库需包含最新版本（GO 2025、KEGG 2025）。

高级分析内容：包含可变剪切分析（需鉴定至少5种可变剪切类型）、融合基因检测、lncRNA靶基因预测（包含cis和trans靶基因）等。

二、服务要求

1.样本接收与处理服务

样本收取规范：提供上门接收样品服务，接收时需核对样本信息（样本名称、数量、保存条件等），并出具样本接收确认单；支持RNA样本（-80℃保存）、组织样本（RNA保存液浸泡或干冰冷冻）等多种类型样本接收。

样本保存与管理：样本在实验期间需保存在符合要求的环境中（-80℃冰箱或液氮罐），并建立样本管理台账，记录样本的接收、存储、使用和剩余情况；实验结束后，剩余样本可根据招标人要求保存≥3个月，逾期需经招标人同意后方可处理。

不合格样本处理：若样本质量不符合文库构建参数要求，需在24小时内书面通知招标人，并提供样本质量检测报告（如Agilent Bioanalyzer检测图谱），协商解决方案。

2.实验过程与质量控制服务

实验方案确认：实验前需向招标人提供详细的实验方案，包括样本处理流程、文库构建步骤、测序参数设置、数据分析流程等，经招标人确认后方可开展实验。

全程质量监控：在RNA提取、文库构建、测序等关键环节设置质量控制点，每个环节需提供相应的质量检测报告（如RNA电泳图、文库浓度测定结果、测序数据质量报告等）；招标人有权对实验过程进行抽查。

实验记录保存：完整记录实验过程中的各项原始数据（如试剂批号、仪器操作参数、实验人员、实验时间等），原始记录需保存≥5年，招标人可随时查阅。

3.数据分析与交付服务

数据分析周期：在所有样本测序完成后，≤10个工作日内完成测序及数据分析并交付结果。

交付内容：需提供纸质版和电子版两种形式的交付物。电子版包括：原始测序数据（FASTQ格式，通过加密固态硬盘交付）、clean data、数据分析报告（含图表和文字说明）、相关分析软件的参数设置文件；纸质版需装订成册，包含数据分析报告及关键质量检测报告。

结果解读服务：交付结果后，需安排专业技术人员（具有≥3年真核转录组测序数据分析经验）提供不少于1次的上门技术支持，结果解读，以及下机数据重新分析，同时解答招标人关于数据分析结果的疑问。

4.技术支持与售后服务

技术服务响应：提供个性化数据分析服务，对于招标人提出的需求，需在7个自然日内上门提供详细解决方案。

实验问题处理：若因中标人原因导致实验失败（如数据质量不达标、样本损坏等），中标人需免费重新进行实验；若重新实验后仍无法达到要求，需退还相应的服务费用。对于因中标人原因造成样本损坏的，若该样本为科研类特殊样本（如珍稀物种样本、临床疑难病例样本等），且存在获取难度较大或无法重复获取的情况，中标人需根据样本获取成本、前期实验投入及项目研究价值等因素，与招标人协商确定赔偿金额，承担由此给招标人造成的全部直接及间接损失。

后续合作支持：在项目完成后，若招标人需要基于本项目数据进行深入分析（如联合分析、个性化分析等），中标人需提供优惠的技术服务；协助招标人撰写科研论文，提供必要的实验方法和数据分析说明。

5.交付及工期：中标人在收到合格样本后10个工作日内完成测序及数据分析并完成交付。

四、询价地点：

******学院雁山校区行政楼国资处******办公室

五、评审办法：

1.本项目评审办法：合理低价法。

2.本项目最高投标限价为：7.488万元。投标报价超过最高投标限价的，投标文件按无效处理。

六、投标要求：

投标人必须于2025年12月2日上午9:30-10:30，******学院雁山校区行政楼国资处******办公室。

投标文件：

1.报价表（必须提供，详见附件1）；

2.企业法人授权委托书（非法定代表人参加时用，详见附件2）；

3.企业法人代表身份证复印件（必须提供）；

4.受委托人身份证复印件（委托代理时需提供）；

5.企业营业执照复印件（必须提供）；

6.“信用中国”网站、“中国政府采购网”等渠道未被列入失信被执行人、重大税收违法失信主体、政府采购严重违法失信行为记录名单。查询资料（必须提供）；

注：本条款规定必须提供的内容，投标人必须提供，否则视为废标。

以上纸质资料需逐页加盖供应商公章和骑缝章并胶封成册，投标文件必须提供纸质版正本、副本各一份，U盘存储电子版一份否则投标无效。

符合要求的投标人不足三家时本项目流标。

联系人：谭明罡          联系电话：******

******学院真核转录组测序采购报价表.docx

附件2：法定代表人授权委托书.docx

******学院真核转录组测序采购合同模板.docx

******学院国有资产管理处

2025年11月26日