项目信息

项目名称：单细胞ATAC(10x)测序项目

项目编号：JJ******

公告开始日期：******87000

公告截止日期：******00000

******服务中心）

付款方式：1.所有货物经甲乙双方验收合格并签署验******银行电汇方式付给乙方全额货款。乙方在合同签订前缴纳中标金额的5%作为履约保证金，验收合格后退还。

联系人：中标后在我参与的项目中查看

联系电话：中标后在我参与的项目中查看

签约时间要求：成交后3个工作日内

到货时间要求：合同签订后，乙方收到检测样品20个工作日内出具服务数据

预算：￥250000.00

收货地址：

供应商资质要求：符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

公告说明：

采购清单

采购商品：单细胞ATAC(10x)测序项目

采购数量：25

计量单位：项

所属分类：

预算：￥10000.00

技术参数及配置要求：服务平台要求：
1基于10x Genomics平台的单细胞捕获技术，通过制备细胞核悬液，用Tn5转座酶对染色质开放区的DNA进行剪切获得单细胞水平的染色质开放情况。

服务数据产出质量和数量要求：
1)文库峰形呈三峰状,三个主峰介于100bp-1000bp；2)DNA文库浓度≥1.5nM；
3)文库测序数据量≥400M reads；
4)Q30>85％；
5)测序数据基因组比对率≥80%；
6)目标捕获细胞数浮动范围在20%以内；
7)Fraction of high-quality fragments overlapping peaks > 25%；
8)Median high-quality fragments per cell > 10000；
9)TSS score > 4；
10)每个样品细胞捕获数量8000-13000之间，鉴定的细胞类型正常，包含组织实质细胞和免疫细胞等类群，与已发表文献无很大偏差；

服务分析要求
1）标准分析：a、测序数据质控：各个样本测序数据质控（reads数、测序饱和度等）与Cell Ranger分析结果质控（Estimated number of cells，Median high-quality fragments per cell，Fraction of high-quality fragments overlapping peaks等）；b、Peak对应的基因和区域注释；c、Peak的可视化分析及展示：基因热图、基因Feature plot图、基因Dot plot图等；d、细胞Cluster/样本间peak差异分析：peak差异火山图、peak表达MA图；e、功能富集分析：peak注释基因的GO功能富集分析、KEGG功能富集分析；f、细胞聚类图：细胞群体cluster聚类、t-SNE聚类及可视化，基因对应peak的可视化图；g、细胞注释图
2）高级分析内容Motif富集分析，Promoter富集分析，GSEA功能富集分析，GSVA功能富集分析，Cluster/cell/sample间相关性分析，多样本整合分析，WGCNA分析，单细胞转录组-单细胞ATAC相关性分析(需要单细胞转录组数据)等。
3）定制化分析内容a、提供邮箱、电话、微信群、线上线下会议等多种方式进行沟通和数据分析探讨；b、利用公司单细胞测序行业专业优势，及时掌握领域研究进展和情报，遇到严峻竞争事态时，向甲方提供预警和差异化研究方案；c、结合公司已有的领域知识和单细胞数据分析经验，对个性化数据分析结果进行解读研判，并制定下一步数据分析方案；d、对于文章投递过程中审稿人的提问及时协助解答，对于补充数据分析按要求进行数据分析并及时提供分析结果；e、免费进行其它合理的定制化数据分析。

售后服务：商品承诺:送货上门/安装调试/技术培训;免费售后分析两年;